Дункан Айдахо, бывший любовник Мурбеллы, управляет кораблем-невидимкой, на борту которого находится возрожденный воин Майлс Тег, преподобная мать Шиана, а также 150 других беженцев. Пока Мурбелла разбирается с жестокими бунтами, охватившими их союз, другой более зловещий враг, Омниус из Синхронизированной Империи, втайне засылает меняющих внешность лицеделов в стан Досточтимых Матрон, планируя уничтожение человечества и возвышение цивилизации машин. Используя генетический материал, беженцы начинают возрождать легендарных личностей из истории Дюны: Пола Муад'Диба, леди Джессику и других, подготавливаясь к давно ожидаемой битве в конце Вселенной.